董哲仁指出，二00二年，中国七大江河水系的七百四十一个监测断面中，仅百分之二十九点一的断面符合Ⅵ类以上水质标准，百分之三十的断面属于人体不能直接接触、仅可用于工农业的Ⅳ、Ⅴ类水质，百分之四十点九的断面属于完全丧失水环境功能的劣Ⅴ类水质；百分之九十流经城市的河段受到严重污染；大部分湖泊氮、磷含量严重超过地面水水质标准。在东部和西南地区被调查的二百多个湖泊中，有百分之八十不同程度富营养化，生态系统全面退化。工农业和生活污染是造成水环境污染的主要原因，从中可以看出，河流污染是河流健康的最大威胁。

董哲仁说，近年来，中国水利系统通过紧急调水解决一些河湖的生态退化问题，取得了一定成效。此外，有些地区正规划兴建大规模调水工程解决河湖生态健康问题。但是，依靠增加水量的方式改善生态环境是有条件的，这种方法对于绿洲生态系统和自然湿地效果较为明显，而对于工业污染严重、人口密集地区效果不显著，或者带有暂时性。因此，改善河流生态状况的根本措施是治污，超越治污阶段试图改善河流生态状况的努力难以奏效。

针对治理问题，董哲仁表示，制定中国河流环境保护战略，有必要研究和借鉴发达国家河流保护的经验教训，特别需要研究其河流环境治理的发展历程。